La mission principale de l'ALQA consiste à gérer un réseau de surveillance de la radioactivité dans l'environnement.
À ce titre, des analyseurs de la radioactivité ambiante ont été implantés sur les quatre départements lorrains.
Une mission d'information du public vient compléter l'exploitation du réseau de mesures.
L'ALQA fait partie des organismes agrées pour la mesure du radon dans les établissements recevant du public et est amenée à intervenir au delà des limites de la Lorraine.
À titre ponctuel et au moyen d'équipements complémentaires des études radioécologiques peuvent être menées